Alguns scripts do Gaussian costumam dar erro devido ao problema de endereçamento de memória. Isso ocorre porque o espaço de memória alocado é insuficiente. Por exemplo, se você estiver tendo um erro do tipo

Out-of-memory error in routine RdGeom-1 (IEnd= 6750021 MxCore=6291456)<br /> Use %mem=7MW to provide the minimum amount of memory required to complete this step.<br /> Error termination via Lnk1e in /share/apps/g09/l101.exe at Tue Jun 26 19:53:27 2012.<br /> Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 0.2 seconds.<br /> File lengths (MBytes): RWF=5 Int=0 D2E=0 Chk=1 Scr=1

Tente alterar o valor mem do seu script. Coloque um valor maior, tal como

%mem=16MW